Pocos meses después de la captura de Abimael Guzmán, el gobierno de Fujimori desmanteló al GEIN. Los oficiales de entonces acusaron al régimen de querer deslucir la labor del equipo. Los agentes de a pie, los que respiraron en la nuca de los senderistas, fueron condenados al anonimato. Por ejemplo, la pareja de policías que tras seguir durante meses a Guzmán acabó casándose.